Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms