Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAT1AQ00266 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAT1AQ00266 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms