Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNTNAP1P78357 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP1P78357 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms