Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms