Protein–RNA interactions for Protein: P78332

RBM6, RNA-binding protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM6P78332 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM6P78332 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM6P78332 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM6P78332 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM6P78332 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM6P78332 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM6P78332 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM6P78332 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM6P78332 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM6P78332 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM6P78332 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM6P78332 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms