Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms