Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB25P57735 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB25P57735 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB25P57735 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB25P57735 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB25P57735 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms