Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms