Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP1P56182 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP1P56182 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms