Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFERP55789 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFERP55789 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GFERP55789 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFERP55789 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFERP55789 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFERP55789 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms