Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP6P55212 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP6P55212 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP6P55212 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP6P55212 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP6P55212 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP6P55212 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP6P55212 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP6P55212 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP6P55212 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP6P55212 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP6P55212 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms