Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms