Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK4P51957 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK4P51957 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK4P51957 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK4P51957 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms