Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLCP48506 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLCP48506 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCLCP48506 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCLCP48506 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCLCP48506 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCLCP48506 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCLCP48506 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms