Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms