Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-1P43699 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-1P43699 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms