Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms