Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARGP37231 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARGP37231 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARGP37231 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARGP37231 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARGP37231 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPARGP37231 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms