Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBRP36941 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBRP36941 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBRP36941 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms