Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA4P35212 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA4P35212 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA4P35212 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA4P35212 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms