Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG3P32926 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG3P32926 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG3P32926 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms