Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms