Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms