Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCAP28676 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCAP28676 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCAP28676 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCAP28676 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCAP28676 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCAP28676 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCAP28676 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCAP28676 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCAP28676 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms