Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE4AP27815 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4AP27815 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms