Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YY1P25490 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YY1P25490 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
YY1P25490 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YY1P25490 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YY1P25490 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YY1P25490 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YY1P25490 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YY1P25490 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YY1P25490 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YY1P25490 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YY1P25490 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YY1P25490 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YY1P25490 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YY1P25490 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YY1P25490 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YY1P25490 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YY1P25490 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YY1P25490 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YY1P25490 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YY1P25490 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YY1P25490 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YY1P25490 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YY1P25490 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YY1P25490 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YY1P25490 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YY1P25490 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YY1P25490 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
YY1P25490 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YY1P25490 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YY1P25490 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YY1P25490 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YY1P25490 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YY1P25490 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms