Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms