Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms