Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCP20941 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCP20941 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCP20941 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCP20941 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCP20941 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCP20941 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCP20941 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCP20941 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCP20941 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCP20941 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms