Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms