Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms