Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms