Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1P11387 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1P11387 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1P11387 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1P11387 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms