Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RARBP10826 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RARBP10826 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RARBP10826 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RARBP10826 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RARBP10826 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RARBP10826 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RARBP10826 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RARBP10826 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RARBP10826 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RARBP10826 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RARBP10826 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RARBP10826 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RARBP10826 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RARBP10826 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RARBP10826 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RARBP10826 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RARBP10826 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RARBP10826 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RARBP10826 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RARBP10826 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RARBP10826 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RARBP10826 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RARBP10826 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms