Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms