Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHGAP10645 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHGAP10645 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHGAP10645 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHGAP10645 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHGAP10645 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CHGAP10645 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHGAP10645 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHGAP10645 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHGAP10645 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHGAP10645 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHGAP10645 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHGAP10645 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHGAP10645 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHGAP10645 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHGAP10645 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHGAP10645 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHGAP10645 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms