Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAA2P0DJI9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms