Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOP08100 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOP08100 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOP08100 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOP08100 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOP08100 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOP08100 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOP08100 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOP08100 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOP08100 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOP08100 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOP08100 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHOP08100 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RHOP08100 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHOP08100 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHOP08100 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms