Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB1P08034 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB1P08034 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB1P08034 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB1P08034 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GJB1P08034 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms