Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDHBP07195 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDHBP07195 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDHBP07195 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDHBP07195 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDHBP07195 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDHBP07195 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDHBP07195 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDHBP07195 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LDHBP07195 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDHBP07195 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDHBP07195 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDHBP07195 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LDHBP07195 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LDHBP07195 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LDHBP07195 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LDHBP07195 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LDHBP07195 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LDHBP07195 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LDHBP07195 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDHBP07195 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDHBP07195 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDHBP07195 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms