Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOAP06340 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms