Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNP04198 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNP04198 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYCNP04198 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYCNP04198 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYCNP04198 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYCNP04198 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYCNP04198 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYCNP04198 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYCNP04198 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYCNP04198 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYCNP04198 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYCNP04198 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms