Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGHV3-7P01780 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGHV3-7P01780 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms