Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA3O96018 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA3O96018 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA3O96018 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA3O96018 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA3O96018 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA3O96018 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA3O96018 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA3O96018 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA3O96018 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA3O96018 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA3O96018 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APBA3O96018 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA3O96018 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA3O96018 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA3O96018 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA3O96018 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA3O96018 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA3O96018 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA3O96018 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA3O96018 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA3O96018 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA3O96018 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA3O96018 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA3O96018 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA3O96018 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBA3O96018 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBA3O96018 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms