Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM37O94972 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM37O94972 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms