Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN15O75808 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms