Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms