Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ABCC9O60706 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms