Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms