Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms